Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndst3Q9EQH7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms