Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms