Protein–RNA interactions for Protein: Q9DD03

Rab13, Ras-related protein Rab-13, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab13Q9DD03 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Rab13Q9DD03 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab13Q9DD03 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms