Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl4Q9DCU6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms