Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCE5

Pak1ip1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1ip1Q9DCE5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pak1ip1Q9DCE5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pak1ip1Q9DCE5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms