Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms