Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tm9sf1Q9DBU0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms