Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms