Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcg8Q9DBM0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcg8Q9DBM0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms