Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ftsj3Q9DBE9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ftsj3Q9DBE9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ftsj3Q9DBE9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ftsj3Q9DBE9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ftsj3Q9DBE9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ftsj3Q9DBE9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ftsj3Q9DBE9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ftsj3Q9DBE9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ftsj3Q9DBE9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ftsj3Q9DBE9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ftsj3Q9DBE9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ftsj3Q9DBE9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ftsj3Q9DBE9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ftsj3Q9DBE9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ftsj3Q9DBE9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ftsj3Q9DBE9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ftsj3Q9DBE9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ftsj3Q9DBE9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ftsj3Q9DBE9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ftsj3Q9DBE9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ftsj3Q9DBE9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ftsj3Q9DBE9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ftsj3Q9DBE9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ftsj3Q9DBE9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ftsj3Q9DBE9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ftsj3Q9DBE9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ftsj3Q9DBE9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ftsj3Q9DBE9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ftsj3Q9DBE9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ftsj3Q9DBE9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ftsj3Q9DBE9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ftsj3Q9DBE9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ftsj3Q9DBE9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ftsj3Q9DBE9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ftsj3Q9DBE9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ftsj3Q9DBE9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms