Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB85

Rrp8, Ribosomal RNA-processing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp8Q9DB85 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp8Q9DB85 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp8Q9DB85 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp8Q9DB85 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp8Q9DB85 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp8Q9DB85 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp8Q9DB85 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rrp8Q9DB85 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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