Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms