Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB16

Cab39l, Calcium-binding protein 39-like, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39lQ9DB16 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms