Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms