Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms