Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmbim4Q9DA39 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmbim4Q9DA39 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms