Protein–RNA interactions for Protein: Q9D915

Tcim, Transcriptional and immune response regulator, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcimQ9D915 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TcimQ9D915 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TcimQ9D915 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms