Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rexo2Q9D8S4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rexo2Q9D8S4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms