Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms