Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slx4ipQ9D7Y9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slx4ipQ9D7Y9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms