Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem54Q9D7S1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Tmem54Q9D7S1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem54Q9D7S1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem54Q9D7S1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem54Q9D7S1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem54Q9D7S1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem54Q9D7S1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem54Q9D7S1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem54Q9D7S1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem54Q9D7S1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem54Q9D7S1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem54Q9D7S1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem54Q9D7S1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem54Q9D7S1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem54Q9D7S1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem54Q9D7S1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem54Q9D7S1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem54Q9D7S1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem54Q9D7S1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem54Q9D7S1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem54Q9D7S1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem54Q9D7S1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem54Q9D7S1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem54Q9D7S1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem54Q9D7S1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem54Q9D7S1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem54Q9D7S1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem54Q9D7S1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem54Q9D7S1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem54Q9D7S1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem54Q9D7S1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem54Q9D7S1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem54Q9D7S1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem54Q9D7S1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem54Q9D7S1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem54Q9D7S1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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