Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D7E4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D7E4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D7E4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D7E4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9D7E4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms