Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms