Protein–RNA interactions for Protein: Q9D720

Nsmce1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce1Q9D720 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nsmce1Q9D720 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms