Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbe1Q9D6Y9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms