Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms