Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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Ttc9bQ9D6E4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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Ttc9bQ9D6E4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Ttc9bQ9D6E4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Ttc9bQ9D6E4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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Ttc9bQ9D6E4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Ttc9bQ9D6E4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Ttc9bQ9D6E4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Ttc9bQ9D6E4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Ttc9bQ9D6E4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms