Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Rab11fip1Q9D620 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Rab11fip1Q9D620 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Rab11fip1Q9D620 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Rab11fip1Q9D620 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab11fip1Q9D620 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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