Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Gm3404Q9D506 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Gm3404Q9D506 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Gm3404Q9D506 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Gm3404Q9D506 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Gm3404Q9D506 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Gm3404Q9D506 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Gm3404Q9D506 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3404Q9D506 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms