Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms