Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
4933428G20RikQ9D3X4 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms