Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms