Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pus10Q9D3U0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms