Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Snx29Q9D3S3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx29Q9D3S3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms