Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms