Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx20Q9D2Y5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms