Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9D2Q3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9D2Q3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9D2Q3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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