Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Chordc1Q9D1P4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms