Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms