Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms