Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Susd3Q9D176 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms