Protein–RNA interactions for Protein: Q9D132

Upk1a, Uroplakin-1a, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1aQ9D132 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1aQ9D132 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1aQ9D132 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1aQ9D132 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1aQ9D132 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1aQ9D132 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1aQ9D132 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1aQ9D132 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1aQ9D132 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1aQ9D132 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1aQ9D132 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1aQ9D132 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1aQ9D132 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1aQ9D132 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Upk1aQ9D132 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Upk1aQ9D132 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Upk1aQ9D132 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Upk1aQ9D132 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Upk1aQ9D132 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Upk1aQ9D132 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms