Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Ift27Q9D0P8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Ift27Q9D0P8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Ift27Q9D0P8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Ift27Q9D0P8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Ift27Q9D0P8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Ift27Q9D0P8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Ift27Q9D0P8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Ift27Q9D0P8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift27Q9D0P8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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