Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mdm1Q9D067 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mdm1Q9D067 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mdm1Q9D067 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mdm1Q9D067 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mdm1Q9D067 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mdm1Q9D067 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mdm1Q9D067 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mdm1Q9D067 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mdm1Q9D067 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdm1Q9D067 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdm1Q9D067 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdm1Q9D067 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdm1Q9D067 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdm1Q9D067 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdm1Q9D067 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdm1Q9D067 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdm1Q9D067 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdm1Q9D067 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdm1Q9D067 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdm1Q9D067 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdm1Q9D067 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdm1Q9D067 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdm1Q9D067 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdm1Q9D067 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdm1Q9D067 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdm1Q9D067 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdm1Q9D067 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdm1Q9D067 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Mdm1Q9D067 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mdm1Q9D067 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mdm1Q9D067 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mdm1Q9D067 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mdm1Q9D067 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mdm1Q9D067 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mdm1Q9D067 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms