Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc47Q9D024 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc47Q9D024 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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