Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc77Q9CZH8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms