Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ44

Nsfl1c, NSFL1 cofactor p47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsfl1cQ9CZ44 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nsfl1cQ9CZ44 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms