Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prelid3bQ9CYY7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms