Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Bud23Q9CY21 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Bud23Q9CY21 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Bud23Q9CY21 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Bud23Q9CY21 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Bud23Q9CY21 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Bud23Q9CY21 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Bud23Q9CY21 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Bud23Q9CY21 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Bud23Q9CY21 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Bud23Q9CY21 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Bud23Q9CY21 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Bud23Q9CY21 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Bud23Q9CY21 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Bud23Q9CY21 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Bud23Q9CY21 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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