Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prdm5Q9CXE0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms